MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid lp56

Total Repeats: 658

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015920	CTT	2	6	122	127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127221
2	NC_015920	AAT	2	6	129	134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127221
3	NC_015920	TCT	2	6	167	172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127221
4	NC_015920	T	6	6	175	180	0 %	100 %	0 %	0 %	343127221
5	NC_015920	T	6	6	182	187	0 %	100 %	0 %	0 %	343127221
6	NC_015920	TCT	2	6	221	226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127221
7	NC_015920	ATT	2	6	259	264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127221
8	NC_015920	TTTTCT	2	12	269	280	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	343127221
9	NC_015920	TCT	2	6	326	331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127221
10	NC_015920	AAGTA	2	10	353	362	60 %	20 %	20 %	0 %	343127221
11	NC_015920	TTC	2	6	454	459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127221
12	NC_015920	CAT	2	6	466	471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127221
13	NC_015920	A	6	6	530	535	100 %	0 %	0 %	0 %	343127221
14	NC_015920	ATA	2	6	563	568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127221
15	NC_015920	AAT	2	6	569	574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127221
16	NC_015920	T	6	6	574	579	0 %	100 %	0 %	0 %	343127221
17	NC_015920	T	6	6	597	602	0 %	100 %	0 %	0 %	343127221
18	NC_015920	CA	3	6	625	630	50 %	0 %	0 %	50 %	343127221
19	NC_015920	TAA	2	6	736	741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127221
20	NC_015920	TCT	2	6	752	757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127221
21	NC_015920	TATC	2	8	759	766	25 %	50 %	0 %	25 %	343127221
22	NC_015920	A	6	6	805	810	100 %	0 %	0 %	0 %	343127221
23	NC_015920	TTGAA	2	10	813	822	40 %	40 %	20 %	0 %	343127221
24	NC_015920	TAA	2	6	880	885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127221
25	NC_015920	ATT	2	6	895	900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127221
26	NC_015920	TCT	2	6	938	943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127221
27	NC_015920	TAT	2	6	1009	1014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127221
28	NC_015920	TTTGA	2	10	1039	1048	20 %	60 %	20 %	0 %	343127221
29	NC_015920	TTTC	2	8	1110	1117	0 %	75 %	0 %	25 %	343127221
30	NC_015920	TA	4	8	1253	1260	50 %	50 %	0 %	0 %	343127221
31	NC_015920	AT	3	6	1281	1286	50 %	50 %	0 %	0 %	343127221
32	NC_015920	TAAGT	2	10	1340	1349	40 %	40 %	20 %	0 %	343127221
33	NC_015920	GCC	2	6	1351	1356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	343127221
34	NC_015920	CCA	2	6	1412	1417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	343127221
35	NC_015920	ATT	2	6	1450	1455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127221
36	NC_015920	GAT	2	6	1503	1508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127221
37	NC_015920	AGT	2	6	1520	1525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127221
38	NC_015920	TCA	2	6	1601	1606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127221
39	NC_015920	GGA	2	6	1625	1630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	343127221
40	NC_015920	CTT	2	6	1653	1658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127221
41	NC_015920	A	6	6	1687	1692	100 %	0 %	0 %	0 %	343127221
42	NC_015920	TAA	2	6	1697	1702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127221
43	NC_015920	T	6	6	1719	1724	0 %	100 %	0 %	0 %	343127221
44	NC_015920	T	6	6	1728	1733	0 %	100 %	0 %	0 %	343127221
45	NC_015920	AATCA	2	10	1774	1783	60 %	20 %	0 %	20 %	343127221
46	NC_015920	TTAA	2	8	1847	1854	50 %	50 %	0 %	0 %	343127221
47	NC_015920	ATT	2	6	1862	1867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127221
48	NC_015920	TAT	3	9	1938	1946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127221
49	NC_015920	ATCT	2	8	1971	1978	25 %	50 %	0 %	25 %	343127221
50	NC_015920	T	7	7	1995	2001	0 %	100 %	0 %	0 %	343127221
51	NC_015920	T	7	7	2007	2013	0 %	100 %	0 %	0 %	343127221
52	NC_015920	A	8	8	2018	2025	100 %	0 %	0 %	0 %	343127221
53	NC_015920	T	6	6	2042	2047	0 %	100 %	0 %	0 %	343127221
54	NC_015920	A	6	6	2056	2061	100 %	0 %	0 %	0 %	343127221
55	NC_015920	ATG	2	6	2104	2109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127221
56	NC_015920	TGA	2	6	2122	2127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127221
57	NC_015920	AAT	2	6	2137	2142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127221
58	NC_015920	CTT	2	6	2212	2217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127221
59	NC_015920	TTATA	2	10	2250	2259	40 %	60 %	0 %	0 %	343127221
60	NC_015920	TTC	2	6	2272	2277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127221
61	NC_015920	CTT	2	6	2280	2285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127221
62	NC_015920	CTT	2	6	2316	2321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127221
63	NC_015920	AAT	2	6	2367	2372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127221
64	NC_015920	AAT	2	6	2416	2421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127221
65	NC_015920	CGC	2	6	2470	2475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	343127221
66	NC_015920	T	6	6	2519	2524	0 %	100 %	0 %	0 %	343127221
67	NC_015920	TTTA	2	8	2578	2585	25 %	75 %	0 %	0 %	343127221
68	NC_015920	CTT	2	6	2604	2609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127221
69	NC_015920	ATA	2	6	2620	2625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127221
70	NC_015920	AGT	2	6	2653	2658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	343127221
71	NC_015920	T	6	6	2743	2748	0 %	100 %	0 %	0 %	343127221
72	NC_015920	AAG	2	6	2771	2776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127221
73	NC_015920	TTC	2	6	2794	2799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127221
74	NC_015920	ATT	2	6	2827	2832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127221
75	NC_015920	TCT	2	6	2849	2854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127221
76	NC_015920	TCC	2	6	2863	2868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	343127221
77	NC_015920	TAT	2	6	2926	2931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127221
78	NC_015920	T	7	7	2931	2937	0 %	100 %	0 %	0 %	343127221
79	NC_015920	T	6	6	2951	2956	0 %	100 %	0 %	0 %	343127221
80	NC_015920	TCA	2	6	2963	2968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127221
81	NC_015920	A	8	8	2970	2977	100 %	0 %	0 %	0 %	343127221
82	NC_015920	GTTT	2	8	3006	3013	0 %	75 %	25 %	0 %	343127221
83	NC_015920	TCT	2	6	3014	3019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127221
84	NC_015920	AT	3	6	3050	3055	50 %	50 %	0 %	0 %	343127221
85	NC_015920	A	6	6	3061	3066	100 %	0 %	0 %	0 %	343127221
86	NC_015920	TAAAA	2	10	3073	3082	80 %	20 %	0 %	0 %	343127221
87	NC_015920	TTC	2	6	3091	3096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127221
88	NC_015920	GCTA	2	8	3103	3110	25 %	25 %	25 %	25 %	343127221
89	NC_015920	AT	4	8	3157	3164	50 %	50 %	0 %	0 %	343127221
90	NC_015920	T	6	6	3164	3169	0 %	100 %	0 %	0 %	343127221
91	NC_015920	T	6	6	3225	3230	0 %	100 %	0 %	0 %	343127221
92	NC_015920	TC	3	6	3235	3240	0 %	50 %	0 %	50 %	343127221
93	NC_015920	TCA	2	6	3321	3326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127221
94	NC_015920	TAATAT	2	12	3450	3461	50 %	50 %	0 %	0 %	343127222
95	NC_015920	A	7	7	3463	3469	100 %	0 %	0 %	0 %	343127222
96	NC_015920	ATTAAT	2	12	3477	3488	50 %	50 %	0 %	0 %	343127222
97	NC_015920	TGG	3	9	3657	3665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	343127222
98	NC_015920	ACT	2	6	3669	3674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127222
99	NC_015920	AT	3	6	3714	3719	50 %	50 %	0 %	0 %	343127222
100	NC_015920	GCC	2	6	3741	3746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	343127222
101	NC_015920	AGGA	2	8	3747	3754	50 %	0 %	50 %	0 %	343127222
102	NC_015920	AATAGG	2	12	3777	3788	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	343127222
103	NC_015920	GCA	2	6	3802	3807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343127222
104	NC_015920	ATT	3	9	3823	3831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127222
105	NC_015920	A	7	7	3868	3874	100 %	0 %	0 %	0 %	343127222
106	NC_015920	A	6	6	3946	3951	100 %	0 %	0 %	0 %	343127222
107	NC_015920	T	6	6	4259	4264	0 %	100 %	0 %	0 %	343127223
108	NC_015920	ATTA	2	8	4290	4297	50 %	50 %	0 %	0 %	343127223
109	NC_015920	CTT	2	6	4310	4315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127223
110	NC_015920	T	6	6	4314	4319	0 %	100 %	0 %	0 %	343127223
111	NC_015920	A	8	8	4323	4330	100 %	0 %	0 %	0 %	343127223
112	NC_015920	TCT	2	6	4363	4368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127223
113	NC_015920	TCA	2	6	4397	4402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127223
114	NC_015920	TAT	2	6	4424	4429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127223
115	NC_015920	T	7	7	4449	4455	0 %	100 %	0 %	0 %	343127223
116	NC_015920	CTC	2	6	4490	4495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	343127223
117	NC_015920	TAAATA	2	12	4560	4571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127223
118	NC_015920	T	9	9	4647	4655	0 %	100 %	0 %	0 %	343127223
119	NC_015920	TTCT	2	8	4676	4683	0 %	75 %	0 %	25 %	343127223
120	NC_015920	TAT	2	6	4688	4693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127223
121	NC_015920	ATC	2	6	4698	4703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127223
122	NC_015920	ATT	2	6	4734	4739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127223
123	NC_015920	TAAT	2	8	4741	4748	50 %	50 %	0 %	0 %	343127223
124	NC_015920	CTA	2	6	4810	4815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127223
125	NC_015920	AAT	2	6	4822	4827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127223
126	NC_015920	T	6	6	4830	4835	0 %	100 %	0 %	0 %	343127223
127	NC_015920	GTT	2	6	4836	4841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343127223
128	NC_015920	T	6	6	4845	4850	0 %	100 %	0 %	0 %	343127223
129	NC_015920	TAA	2	6	4959	4964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127224
130	NC_015920	T	6	6	4979	4984	0 %	100 %	0 %	0 %	343127224
131	NC_015920	CTT	2	6	5001	5006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127224
132	NC_015920	TAA	2	6	5054	5059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127224
133	NC_015920	TA	3	6	5074	5079	50 %	50 %	0 %	0 %	343127224
134	NC_015920	TTC	2	6	5104	5109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127224
135	NC_015920	T	6	6	5132	5137	0 %	100 %	0 %	0 %	343127224
136	NC_015920	CAT	2	6	5193	5198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127224
137	NC_015920	ATT	2	6	5258	5263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127224
138	NC_015920	T	6	6	5288	5293	0 %	100 %	0 %	0 %	343127224
139	NC_015920	AGA	2	6	5381	5386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	343127224
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151	NC_015920	TTTG	2	8	5803	5810	0 %	75 %	25 %	0 %	343127225
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272	NC_015920	GAATT	2	10	10958	10967	40 %	40 %	20 %	0 %	343127229
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274	NC_015920	T	6	6	11027	11032	0 %	100 %	0 %	0 %	343127229
275	NC_015920	TCT	3	9	11109	11117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127229
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277	NC_015920	T	6	6	11299	11304	0 %	100 %	0 %	0 %	343127230
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280	NC_015920	TA	3	6	11501	11506	50 %	50 %	0 %	0 %	343127230
281	NC_015920	TTA	2	6	11526	11531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	343127230
282	NC_015920	GTT	2	6	11613	11618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343127230
283	NC_015920	TTG	2	6	11638	11643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343127230
284	NC_015920	TCA	2	6	11700	11705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	343127230
285	NC_015920	GCA	2	6	11718	11723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	343127230
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301	NC_015920	TAAA	2	8	12986	12993	75 %	25 %	0 %	0 %	343127233
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313	NC_015920	T	6	6	13398	13403	0 %	100 %	0 %	0 %	343127234
314	NC_015920	ACC	2	6	13425	13430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	343127234
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383	NC_015920	A	6	6	16613	16618	100 %	0 %	0 %	0 %	343127238
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387	NC_015920	T	7	7	16702	16708	0 %	100 %	0 %	0 %	343127238
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392	NC_015920	CCT	2	6	16952	16957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	343127238
393	NC_015920	TC	3	6	16961	16966	0 %	50 %	0 %	50 %	343127238
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396	NC_015920	T	6	6	17095	17100	0 %	100 %	0 %	0 %	343127238
397	NC_015920	TGCTT	2	10	17131	17140	0 %	60 %	20 %	20 %	343127238
398	NC_015920	ATTG	2	8	17198	17205	25 %	50 %	25 %	0 %	343127238
399	NC_015920	TGT	2	6	17206	17211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	343127238
400	NC_015920	T	6	6	17222	17227	0 %	100 %	0 %	0 %	343127238
401	NC_015920	TTTC	2	8	17264	17271	0 %	75 %	0 %	25 %	343127238
402	NC_015920	TAA	2	6	17408	17413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	343127239
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404	NC_015920	TCT	2	6	17425	17430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	343127239
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